Военная подготовка в университете началась в 2002 году в соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации. Студенты получили возможность в добровольном порядке проходить курс военной подготовки и становиться офицерами запаса, а с сентября 2014 года проходить военную подготовку на должностях солдат и сержантов с получением военного билета после ее успешного окончания и прохождения учебных сборов.

Профили военной подготовки в максимальной степени приближены к основным образовательным программам университета, что снижает затраты времени и повышает качество подготовки военнослужащих.

Сроки обучения по программам подготовки составляют: для солдат — 1,5 года, сержантов — 2 года, офицеров — 3 года.